Qua kiểm tra, xác minh cho thấy, năm 2019, doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ là 45.055.233.594 đồng, tổng lợi nhuận kế toán trước thuế là 2.268.469.990 đồng.
Năm 2020, doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ là 23.156.480.057 đồng, tổng lợi nhuận kế toán trước thuế là 1.799.652.485 đồng.
Đoàn thanh tra phát hiện công ty chưa lập hồ sơ theo dõi, thẻ quản lý chi tiết từng tài sản cố định theo quy định tại Điều 5 Thông tư 45/2013/TT-BTC ngày 25/3/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn chế độ quản lý, sử dụng và trích khấu hao tài sản cố định.
Bên cạnh đó, công ty hạch toán doanh thu nhận trước từ hoạt động cho thuê tài sản, hạch toán tài khoản tạm ứng chưa đúng theo chế độ kế toán tại Thông tư số 133/2016/TT-BTC ngày 26/8/2016 của Bộ Tài chính.
Ngoài ra, công ty chưa tham gia đầy đủ chế độ bảo hiểm xã hội cho những lao động ký hợp đồng thời vụ làm việc tại các công trình xây dựng, có thời gian trên 1 tháng theo quy định tại Điểm b, Khoản 1 Điều 2 Luật Bảo hiểm xã hội số 58/2014/QH13 ngày 20/11/2014.
Theo Kết luận thanh tra số 11/KL-TTr của Thanh tra tỉnh, công ty xác định không chính xác các khoản chi phí không được trừ khi quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp dẫn đến kê khai thiếu số thuế thu nhập doanh nghiệp số tiền 16.265.092 đồng, thiếu thuế giá trị gia tăng số tiền 69.819.096 đồng theo quy định tại Điều 4 Thông tư 96/2015/TT-BTC ngày 22/6/2015 của Bộ Tài chính; quy định tại Điều 14, Điều 15 Thông tư 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn Luật Thuế giá trị gia tăng.
Công ty cũng chưa kịp thời kê khai doanh thu, kê khai thuế giá trị gia tăng theo quy định tại Điểm m, Khoản 3, Điều 5 Thông tư 78/2014/TT-BTC ngày 18/6/2014 của Bộ Tài chính; Khoản 5, Điều 8 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính, dẫn đến làm tăng thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp, tăng thuế giá trị gia tăng phải nộp.
Thanh tra tỉnh Thái Nguyên đã xác định nguyên nhân của các vi phạm là do kế toán của công ty chưa nghiên cứu đầy đủ và thực hiện đúng các quy định về công tác kế toán, Luật Quản lý thuế, Luật Bảo hiểm xã hội và các văn bản hướng dẫn thi hành để tham mưu cho lãnh đạo công ty, do vậy trong quá trình lãnh đạo, điều hành còn để xảy ra những hạn chế.
Trước vi phạm về thuế, tài chính, Thanh tra tỉnh Thái Nguyên đề nghị công ty tổ chức rút kinh nghiệm và khắc phục những nội dung tồn tại, hạn chế như đã nêu trên; đóng bảo hiểm xã hội đầy đủ cho người lao động theo quy định; thực hiện nghiêm các quy định của pháp luật về công tác kế toán, Luật Quản lý thuế, Luật Bảo hiểm xã hội và các văn bản hướng dẫn thi hành trong kỳ kế toán tiếp theo.
Về kiến nghị xử lý về kinh tế, Thanh tra tỉnh cũng kiến nghị thu hồi về ngân sách Nhà nước số tiền 93.415.941 đồng của Công ty Cổ phần Xây dựng giao thông II Thái Nguyên do kê khai thiếu thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế giá trị gia tăng trong năm 2019, 2020.