(Thanh tra) - Qua thanh tra việc chấp hành chính sách, pháp luật về thuế tại Công ty TNHH Phương Hà, Thanh tra tỉnh Thanh Hóa đã chỉ ra một số sai sót trong kê khai, hạch toán thuế, yêu cầu doanh nghiệp này phải khắc phục, nộp bổ sung hơn 153 triệu đồng vào ngân sách Nhà nước, góp phần tăng cường kỷ cương tài chính, bảo đảm công bằng nghĩa vụ thuế.
Thanh tra tỉnh Thanh Hóa phát hiện chênh lệch trong kê khai và hạch toán thuế
Thực hiện Quyết định số 1969/QĐ-TTTH ngày 8/8/2025 của Thanh tra tỉnh Thanh Hóa về việc thanh tra chấp hành chính sách, pháp luật về thuế tại 4 doanh nghiệp trên địa bàn, Thanh tra tỉnh Thanh Hóa đã tiến hành kiểm tra Công ty TNHH Phương Hà, doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực kinh doanh mô tô, xe máy, xây dựng công trình dân dụng và thương mại vật liệu xây dựng.
Qua kiểm tra hồ sơ, sổ sách, chứng từ kế toán và báo cáo tài chính năm 2024, Thanh tra tỉnh Thanh Hóa xác định tổng doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ của Công ty TNHH Phương Hà đạt trên 164,9 tỷ đồng, lợi nhuận trước thuế đạt 591 triệu đồng, cao hơn 520 triệu đồng so với số liệu doanh nghiệp tự báo cáo.
Tuy nhiên, quá trình thanh tra cho thấy, Công ty TNHH Phương Hà đã xác định và kê khai nghĩa vụ thuế chưa chính xác, dẫn đến việc nộp thiếu cho ngân sách Nhà nước tổng cộng 153,87 triệu đồng, bao gồm thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) 104 triệu đồng và thuế giá trị gia tăng (GTGT) 49,8 triệu đồng.
Cụ thể, Công ty TNHH Phương Hà đã đưa vào chi phí một số khoản không phục vụ hoạt động sản xuất kinh doanh, không đủ điều kiện khấu trừ theo quy định tại Thông tư 96/2015/TT-BTC; trích khấu hao vượt giá trị khống chế đối với ô tô có nguyên giá trên 1,6 tỷ đồng; và ghi nhận doanh thu, chi phí chưa đúng thời điểm đối với công trình “Nâng cấp, mở rộng đường giao thông liên thôn Sài Thôn – Tiên Lượng, xã Minh Khôi, huyện Nông Cống”. Những sai sót này làm tăng thu nhập chịu thuế và kéo theo số thuế TNDN phải nộp bổ sung.
Đối với thuế GTGT, Công ty TNHH Phương Hà cũng bị điều chỉnh giảm phần khấu trừ đầu vào đối với các hóa đơn không đủ điều kiện và tăng thuế đầu ra do ghi nhận doanh thu chưa đúng thời điểm. Từ các nội dung trên, đoàn thanh tra yêu cầu Công ty TNHH Phương Hà nộp bổ sung đầy đủ các khoản thuế còn thiếu theo quy định.
Kê khai các khoản thuế phải nộp chưa chính xác
Cụ thể, Công ty TNHH Phương Hà đã bị xác định, kê khai các khoản thuế phải nộp chưa chính xác, qua kiểm tra xác định các khoản thuế phải nộp ngân sách Nhà nước năm 2024 của công ty tăng thêm 153.870.735 đồng (gồm: thuế TNDN 104.037.944 đồng; thuế GTGT 49.832.791 đồng).
Cụ thể, thuế TNDN giảm chi phí của hàng hóa, dịch vụ không phục vụ cho hoạt động sản xuất kinh doanh trong kỳ, không đủ điều kiện được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế theo quy định tại Điều 4 Thông tư 96/2015/TT-BTC ngày 22/6/2015 của Bộ Tài chính với số tiền 83.522.727 đồng. Do đó, thu nhập để tính thuế TNDN tăng 83.522.727 đồng dẫn đến số thuế TNDN công ty TNHH Phường Hà phải nộp năm 2024 tăng tương ứng 16.704.545 đồng.
Theo đó, việc giảm chi phí khấu hao của xe ô tô (phần trích vượt nguyên giá 1,6 tỷ) theo quy định tại Điều 4 Thông tư 96/2015/TT-BTC ngày 22/6/2015 của Bộ Tài Chính với số tiền 381.250.000 đồng. Do đó, thu nhập để tính thuế TNDN tăng 381.250.000 đồng dẫn đến số thuế TNDN Công ty TNHH Phường Hà phải nộp năm 2024 tăng tương ứng 76.250.000 đồng. Công ty TNHH Phương Hà đã xác định, ghi nhận chưa đúng thời điểm đối với doanh thu từ công trình theo quy định tại khoản 4 Điều 9 Nghị định 123/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính Phủ; Điều 3 Thông tư 96/2015/TT-BTC ngày 22/6/2015 của Bộ Tài chính với số tiền 518.506.481 đồng (phần hạng mục đã nghiệm thu, hoàn thành theo 03 Biên bản nghiệm thu năm 2024 của công trình “Nâng cấp mở rộng đường giao thông liên thôn từ thôn Sài Thôn đi thôn Tiên Lượng xã Minh Khôi, huyện Nông Cống, tỉnh Thanh Hóa”).
Do đó, doanh thu của Công ty TNHH Phương Hà năm 2024 tăng 518.506.481 đồng, giá vốn tăng tương ứng 463.089.488 đồng đồng (chi phí giá vốn theo báo cáo của công ty), dẫn đến thu nhập để tính thuế TNDN tăng 55.416.993 đồng, thuế TNDN công ty phải nộp năm 2024 tăng 11.083.399 đồng. Như vậy, từ những lý do trên, tổng số thuế TNDN của Công ty TNHH Phương Hà phải nộp năm 2024 tăng 104.037.944 đồng.
Về thuế GTGT, giảm thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ không phục vụ cho hoạt động sản xuất kinh doanh trong kỳ, không đủ điều kiện được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế với số tiền 8.352.273 đồng, tương ứng tổng giá trị mua vào là 83.522.727 đồng. Do đó, dẫn đến thuế GTGT Công ty TNHH Phương Hà phải nộp năm 2024 tăng 8.352.273 đồng. Thuế GTGT đầu ra phải nộp tăng 41.480.519 đồng (thuế suất 8%) theo quy định tại khoản 4 Điều 9 Nghị định 123/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ; Điều 8 Thông tư 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính do xác định, ghi nhận chưa đúng thời điểm đối với doanh thu từ công trình “Nâng cấp mở rộng đường giao thông liên thôn từ thôn Sài Thôn đi thôn Tiên Lượng xã Minh Khôi, huyện Nông Cống, tỉnh Thanh Hóa”. Vì vậy, đã dẫn đến, thuế GTGT công ty phải nộp năm 2024 tăng 41.480.518 đồng. Như vậy, từ những lý do trên, tổng số thuế GTGT công ty phải nộp năm 2024 tăng 49.832.791 đồng.
Từ kết quả thanh tra này, Thanh tra tỉnh Thanh Hóa kiến nghị Công ty TNHH Phương Hà tổ chức kiểm điểm, rút kinh nghiệm, đồng thời điều chỉnh sổ sách kế toán theo đúng chế độ hiện hành, niêm yết công khai kết luận thanh tra tại trụ sở theo quy định của Luật Thanh tra năm 2025.
Về phía Thuế tỉnh Thanh Hóa, Thanh tra tỉnh Thanh Hóa đề nghị chỉ đạo Thuế cơ sở thực hiện việc tính phạt chậm nộp và xử lý vi phạm hành chính theo quy định của Luật Quản lý thuế đối với các khoản chênh lệch phát hiện qua thanh tra, đảm bảo tính răn đe và kỷ cương trong lĩnh vực thuế.
