Thủ tướng giao Bộ Công thương, PVN thực hiện triệt để các kiến nghị nêu trong kết luận thanh tra, nghiêm túc kiểm điểm và có hình thức xử lý theo quy định đối với tập thể, cá nhân liên quan đến sai phạm, khuyết điểm.Theo Thanh tra Chính phủ (TTCP), sau khi có ý kiến của Thủ tướng Chính phủ về việc xử lý sau thanh tra, PVN đã chủ động thực hiện và chỉ đạo các đơn vị liên quan triển khai thực hiện các kiến nghị của TTCP. Đến nay, PVN đã thu hồi và chỉ đạo đơn vị thành viên thu hồi tiền từ việc cổ phần hóa và lãi chậm nộp mà một số đơn vị chưa nộp về Quỹ Hỗ trợ sắp xếp doanh nghiệp. Tổng Cty Cổ phần (CP) Khí Việt Nam đã nộp hơn 1,9 nghìn tỷ đồng (sau khi trừ chi phí cổ phần hóa) và hơn 188,7 tỷ đồng tiền lãi chậm nộp. Cty CP Hóa dầu Dầu khí VIDAMO đã nộp hơn 30,1 tỷ đồng (bao gồm tiền chênh lệch giá trị vốn Nhà nước tại thời điểm quyết toán cổ phần hóa và vốn Nhà nước tại Cty CP). Điều chỉnh đúng nguồn đối với khoản tiền hơn 11,8 tỷ đồng được sử dụng từ Quỹ Nghiên cứu Khoa học và Đào tạo mà PVN đã sử dụng để xây dựng Trường THPT Đất Mũi và khoản tiền hơn 20,6 tỷ đồng được sử dụng từ Quỹ Đầu tư Phát triển mà PVN đã sử dụng để xây dựng Trường Mầm non Trà My (TP Vũng Tàu). Ngày 27/9/2011, PVN cũng đã có quyết định điều chỉnh hạch toán nguồn vốn từ nguồn Quỹ Nghiên cứu Khoa học và Đào tạo sang nguồn hỗ trợ an sinh xã hội của Tập đoàn và việc sử dụng Quỹ Dự phòng an sinh xã hội để tài trợ đầu tư xây dựng Trường Mầm non Trà My.Trụ sở Tập đoàn Dầu khí Quốc gia. Ảnh: Phương HiếuVề việc sử dụng hơn 15,6 nghìn tỷ đồng cho các hoạt động tài chính không thuộc dự án trọng điểm dầu khí như: Góp vốn liên doanh Rusvietpetro; cung cấp hoạt động tài chính theo hợp đồng nhận nợ cho liên doanh Rusvietpetro và cấp vốn điều lệ cho Tổng Cty Thăm dò Khai thác Dầu khí (PVEP), ngày 14/10/2011, Thủ tướng Chính phủ có quyết định ban hành tiêu chí xác định công trình, dự án dầu khí được phép sử dụng tiền lãi dầu, khí được Nhà nước để lại cho PVN.Tiếp đó, ngày 5/7/2012, Bộ Công thương có công văn phê duyệt danh mục công trình, dự án dầu khí được phép sử dụng tiền lãi dầu khí để lại cho PVN. Theo đó, các hoạt động tài chính góp vốn liên doanh Rusvietpetro; cung cấp hoạt động tài chính theo hợp đồng nhận nợ cho liên doanh Rusvietpetro và cấp vốn điều lệ cho PVEP đều được sử dụng cho các công trình trọng điểm dầu khí.Liên quan đến việc điều chỉnh nguồn chi từ Quỹ Đầu tư Phát triển cho địa phương để xây dựng các công trình không phải là công trình dầu khí đối với công trình đường vào ấp Bao Nhàn, xã Hồ Thị Kỷ giá trị hơn 40,2 tỷ đồng, ngày 28/9/2012, PVN ban hành quyết định điều chỉnh nguồn vốn đầu tư xây dựng công trình sang nguồn hỗ trợ an sinh xã hội. PVN đã có báo cáo với các Bộ: Tài chính, Kế hoạch và Đầu tư để có biện pháp thu hồi các khoản tiền PVN đã ứng vốn xây dựng các công trình ngoài hàng rào Nhà máy Lọc dầu Dung Quất (Quảng Ngãi) và một số công trình thuộc các địa phương khác theo chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ, nhưng các đơn vị được ứng vốn đều không có kế hoạch trả nợ hoặc không có khả năng thanh toán.Liên quan đến xử lý hành chính, PVN và các đơn vị thành viên cũng đã tiến hành kiểm điểm trách nhiệm của tập thể, cá nhân có liên quan đến những khuyết điểm, vi phạm được TTCP chỉ ra.Tuy nhiên, vẫn còn một số kiến nghị của TTCP, PVN chưa thực hiện như: Tham mưu cho Thủ tướng Chính phủ ban hành quy định cụ thể việc thực hiện Quyết định số 40/2007/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ liên quan đến việc thu dọn mỏ để các nhà thầu thực hiện; chưa thu hồi số tiền thu được từ bán cổ phần và tiền chênh lệch vốn Nhà nước khi quyết toán cổ phần hóa với số tiền hơn 49,34 tỷ đồng tại Tổng Cty CP Máy và Phụ tùng (chưa bao gồm tiền lãi); chưa thực hiện việc thanh toán số tiền hơn 111,7 tỷ đồng việc chuyển nhượng Khách sạn Thái Bình giữa PVEP và Tổng Cty CP Xây lắp dầu khí Việt Nam (PVC).Từ kết quả trên, Tổng Thanh tra kiến nghị PVN tiếp tục thực hiện nghiêm túc các nội dung còn lại theo kết luận, kiến nghị của TTCP đối với việc chấp hành quy định của pháp luật về quản lý sử dụng vốn, tài sản tại PVN. Cụ thể: Tham mưu cho Bộ Công thương, Thủ tướng Chính phủ ban hành quy định cụ thể việc thực hiện Quyết định số 40 của Thủ tướng Chính phủ. Tiếp tục phê duyệt kế hoạch thu dọn mỏ của một số hợp đồng dầu khí như đã nêu tại kết luận thanh tra. Có biện pháp thu hồi các khoản tiền đã ứng vốn xây dựng các công trình ngoài hàng rào Nhà máy Lọc dầu Dung Quất (Quảng Ngãi) và một số công trình thuộc các địa phương khác theo chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ với hơn 1,6 tỷ đồng.Đồng thời, TTCP kiến nghị PVN tiếp tục yêu cầu Tổng Cty CP Máy và Phụ tùng nộp 49,34 tỷ đồng thu từ bán cổ phần và tiền chênh lệch vốn Nhà nước khi quyết toán cổ phần hóa cùng với tiền lãi chậm nộp về Quỹ Hỗ trợ Sắp xếp doanh nghiệp của Tập đoàn; yêu cầu PVC thanh toán cho PVEP số tiền hơn 111,7 nghìn tỷ đồng từ việc chuyển nhượng Khách sạn Thái Bình.