Thanh tra tỉnh Hưng Yên triển khai nhiệm vụ 6 tháng cuối năm 2026. Ảnh: PV

Nhiều tồn tại, hạn chế

Kết luận thanh tra ghi nhận doanh nghiệp đã cơ bản chấp hành các quy định về kê khai, nộp nhiều loại thuế, song đồng thời chỉ ra một số tồn tại, hạn chế trong việc hạch toán chi phí và xác định nghĩa vụ thuế thu nhập doanh nghiệp, qua đó kiến nghị xử lý, truy thu số tiền gần 189 triệu đồng vào ngân sách Nhà nước.

Công ty TNHH Phú Cường hoạt động trong lĩnh vực sản xuất linh kiện ô tô, xe máy và linh kiện nhựa công nghiệp, thực hiện kê khai thuế theo phương pháp khấu trừ. Đoàn thanh tra tiến hành kiểm tra việc thực hiện nghĩa vụ đối với ngân sách Nhà nước trong giai đoạn 2024-2025 theo quyết định của Chánh Thanh tra tỉnh Hưng Yên.

Qua thanh tra cho thấy, đối với thuế giá trị gia tăng (GTGT), doanh nghiệp đã thực hiện kê khai, nộp thuế đầy đủ theo quy định. Tổng số thuế GTGT phải nộp trong 2 năm là hơn 5,9 tỷ đồng và đã được doanh nghiệp nộp đủ vào ngân sách Nhà nước. Đoàn thanh tra không phát hiện tồn tại, vi phạm trong việc chấp hành pháp luật về thuế GTGT.

Tương tự, việc thực hiện nghĩa vụ về thuế thu nhập cá nhân, thuế xuất nhập khẩu, lệ phí môn bài, thuế sử dụng đất phi nông nghiệp và tiền thuê đất hằng năm cũng được đánh giá cơ bản đúng quy định. Công ty đã kê khai, nộp đầy đủ các khoản thuế, phí và tiền thuê đất phát sinh trong thời kỳ thanh tra; đoàn thanh tra không phát hiện sai phạm đối với các lĩnh vực này.

Thanh tra tỉnh Hưng Yên công bố quyết định thanh tra chuyên đề về nhà, đất dôi dư sau sắp xếp ngày 15/5/2026. Ảnh: PV

Tuy nhiên, qua kiểm tra hồ sơ quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), Thanh tra tỉnh Hưng Yên xác định vẫn còn một số khoản chi phí chưa bảo đảm điều kiện để được tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế. Sau khi rà soát, đoàn thanh tra giảm chi phí không hợp lý với tổng số tiền gần 944 triệu đồng, qua đó làm tăng số thuế TNDN phải nộp thêm gần 189 triệu đồng, trong đó năm 2024 phải nộp bổ sung hơn 16,6 triệu đồng và năm 2025 phải nộp bổ sung hơn 172,1 triệu đồng.

Cụ thể, một trong những tồn tại được chỉ ra là doanh nghiệp hạch toán một số khoản tiền thưởng cho người lao động nhưng không quy định rõ điều kiện và mức hưởng theo quy định. Đồng thời, công ty còn hạch toán chi phí khấu hao đối với Văn phòng đại diện tại Thành phố Hồ Chí Minh chưa đúng quy định của Bộ Tài chính, dẫn đến phải điều chỉnh giảm chi phí quản lý kinh doanh hơn 83 triệu đồng.

Bên cạnh đó, đoàn thanh tra xác định công ty hạch toán một số khoản chi phí tài chính chưa phù hợp. Trong đó có khoản thanh toán lãi vay cho cá nhân với giá trị từ 5 triệu đồng trở lên nhưng không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt theo quy định. Ngoài ra, doanh nghiệp còn hạch toán chi phí lãi vay liên quan đến thuế thu nhập cá nhân đối với các khoản vay của cá nhân chưa đúng quy định của pháp luật về thuế TNDN. Những nội dung này khiến chi phí tài chính phải điều chỉnh giảm hơn 860 triệu đồng.

Phó Chánh Thanh tra tỉnh Hưng Yên ông Đào Duy Thái tại hội nghị sơ kết 1 năm thành lập và hoạt động của Thanh tra tỉnh. Ảnh: PV

Thanh tra tỉnh Hưng Yên đánh giá, bên cạnh những kết quả đạt được, việc xác định chi phí được trừ khi tính thuế TNDN vẫn còn những hạn chế cần khắc phục. Nguyên nhân chủ yếu xuất phát từ việc doanh nghiệp chi tiền thưởng nhưng chưa quy định cụ thể điều kiện, mức hưởng; hạch toán chi phí khấu hao văn phòng đại diện chưa đúng quy định; thanh toán lãi vay chưa đáp ứng yêu cầu về chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt và hạch toán một số khoản chi phí tài chính chưa đúng quy định pháp luật về thuế.

Yêu cầu các đơn vị nghiêm túc thực hiện kết luận thanh tra

Trên cơ sở kết quả thanh tra, Chánh Thanh tra tỉnh Hưng Yên đã đưa ra nhiều kiến nghị nhằm bảo đảm việc thực hiện nghiêm các quy định của pháp luật về thuế. Đối với Công ty TNHH Phú Cường, Thanh tra tỉnh quyết định thu hồi số tiền thuế TNDN phải nộp tăng thêm qua thanh tra gần 189 triệu đồng do doanh nghiệp kê khai quyết toán chưa đúng quy định. Đồng thời, công ty có trách nhiệm nộp toàn bộ số tiền này vào tài khoản tạm giữ của Thanh tra tỉnh trước ngày 15/7/2026 theo quy định.

Bên cạnh yêu cầu thực hiện nghĩa vụ tài chính, Thanh tra tỉnh cũng đề nghị Công ty TNHH Phú Cường tiếp tục phát huy những kết quả đã đạt được, đồng thời nghiêm túc khắc phục toàn bộ các tồn tại, hạn chế đã được chỉ ra trong kết luận thanh tra nhằm nâng cao hiệu quả công tác quản trị tài chính, kế toán và tuân thủ pháp luật về thuế trong hoạt động sản xuất, kinh doanh.

Đối với cơ quan Thuế tỉnh Hưng Yên, Thanh tra tỉnh kiến nghị căn cứ quy định của pháp luật để xem xét, xử lý các tồn tại, hạn chế được phát hiện qua thanh tra đối với doanh nghiệp. Đồng thời, Công ty TNHH Phú Cường và các đơn vị có liên quan được yêu cầu tổ chức thực hiện nghiêm kết luận thanh tra, báo cáo kết quả thực hiện kèm tài liệu chứng minh về Thanh tra tỉnh trước ngày 15/8/2026.