Theo kết luận thanh tra, các số liệu hạch toán của Cty Tân Khánh ghi nhận doanh thu thiếu giá trị các công trình xây dựng đã hoàn thành, nghiệm thu và bàn giao cho các chủ đầu tư trước và trong năm 2015 trên 5,7 tỷ đồng; hạch toán phân bổ thiếu giá trị vốn hàng bán trên 5,6 tỷ đồng; xác định lợi nhuận trước thuế giảm trên 166,8 triệu đồng.

Bên cạnh đó, Cty Tân Khánh cũng chưa thực hiện việc mở các loại sổ như sổ đăng ký chứng từ ghi sổ, sổ quỹ tiền mặt của thủ quỹ và thẻ tài sản cố định; trích khấu hao tài sản cố định theo quy định tại Thông tư 203/2009 và Thông tư 45/2013 của Bộ Tài chính về việc hướng dẫn chế độ quản lý, sử dụng và trích khấu hao tài sản cố định; hạch toán chưa đầy đủ, kịp thời, chính xác các khoản doanh thu, chi phí nên dẫn đến việc xác định kết quả sản xuất kinh doanh chưa chính xác; chưa thực hiện điều chỉnh số liệu trên sổ sách kế toán và báo cáo tài chính sai biên bản kiểm tra của Chi cục Thuế huyện Định Hóa.

Tính đến thời điểm thanh tra, Cty Tân Khánh chậm nộp trên 222,6 triệu đồng tiền thuế giá trị gia tăng đã kê khai năm 2015. Đồng thời, xuất hóa đơn không đúng thời  điểm trong năm 2015 là trên 557,7 triệu đồng. Trong đó, công trình đã được nghiệm thu, bàn giao cho chủ đầu tư trong năm 2014, năm 2015 nhưng đến năm 2016 mới thực hiện xuất hóa đơn và kê khai thuế giá trị gia tăng là trên 268,4 triệu đồng; số thuế giá trị gia tăng chưa xuất hóa đơn và  thực hiện kê khai là trên 309,2 triệu đồng. Cũng do hạch toán chưa xác định doanh thu, chi phí nên Cty xác định còn thiếu trên 37,7 triệu đồng thuế thu nhập doanh nghiệp.

Ngoài ra, Cty Tân Khánh chưa thực hiện lập danh sách đăng ký tham gia bảo hiểm xã hội, bảo hiểm y tế, bảo hiểm thu nhập bắt buộc với cơ quan bảo hiểm đối với người lao động từ trên 3 tháng đến dưới 12 tháng theo quy định; nghiệm thu khối lượng một số hạng mục của 4 công trình chưa chính xác với thực tế, dẫn đến quyết toán tăng sai với giá trị gia tăng là trên 62,2 triệu đồng.

Thanh tra tỉnh kiến nghị Cty Tân Khánh chấn chỉnh công tác hạch toán, kế toán; lập sổ kế toán đầy đủ các nội dung theo quy định của Luật Kế toán; thực hiện hạch toán ghi nhận doanh thu, chi phí, kê khai và nộp đầy đủ các khoản thuế kịp thời theo quy định.

Đồng thời, làm thủ tục đề nghị Ban Quản lý các dự án đầu tư và xây dựng huyện Định Hóa giám trừ quyết toán công trình Trung tâm dạy nghề huyện Định Hóa số tiền 11,1 triệu đồng. Thu hồi số tiền trên 393,4 triệu đồng vào tài khoản tạm giữ của Thanh tra tỉnh.

Thái Hải