Năm 2023, Thanh tra Bộ thực hiện 25 cuộc thanh tra, kiểm tra, trong đó có 13 cuộc thanh tra hành chính, 06 cuộc thanh tra chuyên ngành và 06 cuộc kiểm tra (đã ban hành kết luận 13 cuộc thanh tra, báo cáo, kết luận 05 cuộc kiểm tra). Các cục thực hiện 23 cuộc thanh tra chuyên ngành theo kế hoạch (đã ban hành kết luận 17 cuộc thanh tra).

Thanh tra Bộ đã thực hiện 13 cuộc thanh tra hành chính, đã ban hành kết luận 07 cuộc thanh tra, phát hiện vi phạm về kinh tế số tiền 15,170 tỷ đồng, trong đó kiến nghị thu hồi về ngân sách Nhà nước 11,744 tỷ đồng, kiến nghị giảm trừ số tiền 3,250 tỷ đồng, kiến nghị xử lý khác số tiền 175,745 triệu đồng.

Thanh tra Bộ đã thực hiện 06 cuộc thanh tra chuyên ngành, đã ban hành kết luận cả 06 cuộc; ban hành 07 quyết định xử phạt vi phạm hành chính (lĩnh vực chứng nhận chất lượng, chứng nhận hợp quy, an toàn thực phẩm) với số tiền xử phạt là 523.500.000 đồng (tăng 01 quyết định và tăng 296.500.000 đồng so với năm 2022); buộc doanh nghiệp hoàn trả số tiền thu lợi bất hợp pháp 369.742.118 đồng.

Qua công tác thanh tra đã phát hiện nhiều tồn tại, bất cập về thể chế, chính sách; các tồn tại, thiếu sót, khuyết điểm trong việc thực hiện chức năng quản lý Nhà nước của một số cơ quan, đơn vị thuộc Bộ trong các lĩnh vực quản lý ngân sách, quản lý, sử dụng tài sản công, khoa học, công nghệ, quản lý đầu tư xây dựng; trong việc thực hiện các quy định của pháp luật về chuyên ngành tại các cơ quan trong hệ thống ngành NN&PTNT tại các địa phương. Qua đó đã hướng dẫn, kiến nghị chấn chỉnh, rút kinh nghiệm, kiến nghị với các cơ quan thuộc Bộ và các cơ quan có liên quan giải thích, sửa đổi, hoàn thiện các quy định; kiến nghị xử lý trách nhiệm, chấn chỉnh đối với các tập thể, cá nhân có liên quan.

Các cục được giao chức năng thanh tra chuyên ngành của Bộ NN&PTNT đã tổ chức thực hiện 23 cuộc thanh tra theo Kế hoạch thanh tra năm 2023, đã ban hành kết luận thanh tra của 17 cuộc thanh tra. Qua thanh tra đã phát hiện và ban hành 04 quyết định xử phạt hành chính đối với 04 đơn vị có hành vi vi phạm.

Thực hiện nhiệm vụ do Ban Cán sự Đảng và Bộ giao, Thanh tra Bộ đã tổ chức thực hiện 06 cuộc kiểm tra; đã báo cáo kết quả kiểm tra 05 cuộc; trong đó đã kiến nghị xử lý trách nhiệm của các tập thể và cá nhân có liên quan.

Thanh tra Bộ tiếp tục đôn đốc các cơ quan, đơn vị thực hiện triệt để các kiến nghị trong kết luận thanh tra cả về xây dựng thể chế, xử lý kinh tế và xử lý trách nhiệm đối với tập thể, cá nhân vi phạm. Đồng thời, tham mưu Bộ chỉ đạo và đôn đốc các đơn vị thực hiện các nội dung kiến nghị liên quan đến Bộ tại các kết luận thanh tra của Thanh tra Chính phủ, tổng hợp, báo cáo Thanh tra Chính phủ; báo cáo kết quả thực hiện Kết luận thanh tra số 1120/KLTT-TTCP của Thanh tra Chính phủ tại Công ty Trách nhiệm hữu hạn MTV Xuất nhập khẩu Nông sản thực phẩm Hà Nội.

Lũy kế số tiền các đơn vị nộp về tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ là 8.062.420.902 đồng.