Dự án nhà ven đê bao TP Quảng Ngãi do Cty Trường Xuân đầu tư

Cty Trường Xuân do ông Lương Hữu Tiến làm Giám đốc (trụ sở tại lô A113, khu dân cư IVB1, phường Trần Phú, TP Quảng Ngãi), đăng ký hoạt động lần đầu vào tháng 3/2002.

Theo Tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) năm 2006 do Cty lập, đơn vị đã tự xác định được miễn thuế thu nhập phát sinh trong năm là 580,7 triệu đồng và không kê khai TNDN đối với hoạt động chuyển quyền sử dụng đất (SDĐ), chuyển quyền thuê đất năm 2006. Mãi đến ngày 27/6/2008, Cty mới có công văn bổ sung hồ sơ khai theo yêu cầu của Cục Thuế tỉnh, trong đó nêu rõ doanh thu từ chuyển nhượng đất là hơn 2 tỷ đồng, thuế thu nhập từ chuyển quyền SDĐ là 770 triệu đồng, nhưng lại đề nghị được bảo lưu nội dung ưu đãi về miễn, giảm thuế. 

Năm 2007, Cty tiếp tục phát sinh thu nhập từ chuyển nhượng nhà đất là chủ yếu, với số tiền hơn 13 tỷ đồng. Ngày 1/3/2008, Cty kê khai quyết toán thuế và tự xác định được miễn, giảm thuế TNDN hơn 3,65 tỷ đồng và kèm theo phụ lục lập cùng ngày (thuế TNDN về chuyển quyền SDĐ năm 2007), Cty xác định thuế TNDN từ chuyển quyền SDĐ là 2,3 tỷ đồng.

Ngày 15/5/2008, Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Ngãi ban hành Quyết định số 789/QĐ-UBND về thanh tra việc chấp hành chính sách, pháp luật Nhà nước tại Cục Thuế tỉnh. Qua đó, phát hiện Cty Trường Xuân tự miễn, giảm thuế TNDN trong 2 năm (2006 - 2007) với số tiền 3 tỷ đồng, kê khai sai phần thuế thu nhập bổ sung không đúng quy định, dẫn đến kê khai thiếu số thuế thu nhập từ chuyển nhượng đất năm 2007 so với số liệu Cty đã kê khai và gửi Cục Thuế là 584,5 triệu đồng...

Trên cơ sở biên bản vi phạm, theo ý kiến thống nhất của Cục Thuế tỉnh, ngày 3/10/2008, Chủ tịch UBND tỉnh ban hành Quyết định số 111/QĐ-XPHC, xử phạt Cty Trường Xuân mức phạt 10% trên tổng số thuế kê khai sai thuộc năm 2007 là 289,7 triệu đồng. Mức phạt 0,05%/ngày, tính trên số tiền thuế chậm nộp với số tiền xử phạt chậm nộp thuế năm 2007 là 220 triệu đồng. Truy thu số tiền thuế thu nhập từ việc chuyển nhượng đất trong 2 năm là 3,66 tỷ đồng. Tổng cộng số tiền phạt vi phạm hành chính và truy thu hơn 4,1 tỷ đồng, Cty đã nộp vào tài khoản tạm giữ của Thanh tra tỉnh.

Ngày 31/10/2008, Cty Trường Xuân có đơn khiếu nại, cho rằng việc xử phạt 289,7 triệu đồng về khai sai thuế và 220 triệu đồng về chậm nộp thuế cùng với toàn bộ số tiền truy thu là không đúng... Lý do Cty đưa ra là: Cty thành lập năm 2002 theo Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh số 3402000079 ngày 11/3/2002 do Phòng Đăng ký kinh doanh (Sở Kế hoạch và Đầu tư Quảng Ngãi) cấp nên thuộc đối tượng được ưu đãi miễn, giảm thuế TNDN, kể cả thu nhập từ chuyển quyền SDĐ trong 2 năm đầu tiên kể từ khi có thu nhập (2006 - 2007) và được miễn, giảm thuế TNDN từ chuyển nhượng đất trong 2 năm tiếp theo, căn cứ theo Luật thuế TNDN năm 1997.

Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Ngãi giao Chánh Thanh tra tỉnh rà soát, thẩm tra và có Quyết định giải quyết khiếu nại số 532/QĐ-UBND ngày 31/3/2009, bác đơn khiếu nại của Cty, vì: Luật Thuế TNDN năm 1997 và các nghị định, văn bản hướng dẫn thi hành không điều chỉnh khoản thu nhập từ chuyển quyền SDĐ, mà được điều chỉnh bởi Luật Thuế chuyển quyền SDĐ năm 1994 và Luật Sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế chuyển quyền SDĐ số 17/1999/QH10 ngày 21/12/1999. Do vậy, hoạt động chuyển quyền SDĐ của Cty không được điều chỉnh bởi Luật Thuế TNDN năm 1997. Đến ngày 17/6/2003, Quốc hội ban hành Luật Thuế TNDN số 09/2003/QH11, trong đó điểm 2, Điều 21, Chương VIII quy định: “Bãi bỏ quy định về thuế chuyển quyền SDĐ đối với cơ sở kinh doanh quy định tại Luật Thuế chuyển quyền SDĐ. Thu nhập từ chuyển quyền SDĐ của cơ sở kinh doanh phải chịu thuế TNDN theo quy định của Luật này”.

Bên cạnh đó, Điều 10 và Điều 15, Chương III Nghị định số 164/2003/NĐ-CP ngày 22/12/2003 của Chính phủ về xác định thu nhập chịu thuế và thuế thu nhập từ chuyển quyền SDĐ, chuyển quyền thuê đất, nêu rõ: “... Không áp dụng mức thuế ưu đãi, miễn thuế, giảm thuế quy định tại Chương V của Nghị định này đối với thu nhập từ hoạt động chuyển quyền SDĐ, chuyển quyền thuê đất”.

Như vậy, việc UBND tỉnh Quảng Ngãi ra quyết định truy thu, xử phạt vi phạm hành chính về kê khai và chậm nộp thuế TNDN đối với Cty Trường Xuân là có cơ sở, đúng pháp luật.

Không đồng ý, Cty Trường Xuân đã khởi kiện quyết định của Chủ tịch UBND tỉnh ra tòa.

Nguyễn Ngọc Phó

(Còn nữa)