Thanh tra cũng ghi nhận, công tác quản lý chất lượng công trình, công tác thanh toán còn tồn tại như hồ sơ khảo sát, chỉ dẫn kỹ thuật của dự án chưa đầy đủ, tính toán sai khối lượng, áp sai cấp đất, định mức, đơn giá vật tư, vật liệu, chi phí nhân công... làm tăng giá gói thầu so với thực tế; tiến độ thực hiện dự án chưa đảm bảo thời gian, năng lực tư vấn thiết kế, giám sát, thẩm định chưa cao, hồ sơ quản lý chất lượng chưa được lưu đủ theo quy định. Nghiệm thu thanh toán còn sai sót do tính toán khối lượng không chính xác; quy định điều chỉnh nhân công, giá vật liệu theo dự toán, nhưng không quy định cụ thể theo dự toán trúng thầu của nhà thầu hay dự toán được duyệt, một số nhà thầu dự thầu đưa giá trị nhân công lớn và khi điều chỉnh theo đơn giá nhà thầu thì giá trị bổ sung cao…

Theo các kết luận thanh tra, Thanh tra Bộ yêu cầu xử lý về kinh tế là 1.105 tỷ đồng sai phạm. Cụ thể, số tiền giảm trừ, thanh quyết toán và thu hồi về quỹ hỗ trợ sắp xếp doanh nghiệp 337 tỷ đồng. Số tiền thuế, tiền thuê đất và áp sai đơn giá thuê đất phải nộp ngân sách Nhà nước 516 tỷ đồng. Giảm trừ do điều chỉnh phê duyệt lại dự toán, lập dự toán chưa đúng quy định 237 tỷ đồng. Kiến nghị thu hồi về tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ 13 tỷ đồng (đã thực hiện thu hồi về tài khoản tạm giữ của Thanh tra Bộ: 865 triệu đồng).

Về xử phạt vi phạm hành chính, Thanh tra Bộ đã ban hành 15 quyết định xử phạt vi phạm hành chính với số tiền 1,5 tỷ đồng. Đã có 8 đơn vị thực hiện quyết định xử phạt với số tiền 1,3 tỷ đồng.

PVL