Bị cáo Nguyễn Kim Phúc, nguyên Giám đốc Sở TN&MT kiêm Giám đốc Chương trình Semla từ 36 tháng tù giam giảm xuống còn 36 tháng tù cho hưởng án treo. Tương tự, bị cáo Hà Thượng Trúc, nguyên Kế toán trưởng Sở TN&MT kiêm Kế toán trưởng Chương trình Semla và Nguyễn Văn Mẫu, nguyên Chánh Văn phòng Sở kiêm Chánh Văn phòng Chương trình Semla, mỗi bị cáo từ 30 tháng tù giam giảm xuống còn 30 tháng tù cho hưởng án treo. Bị cáo Phúc vắng mặt do bị bệnh nặng, đang điều trị tại Bệnh viện Thống Nhất (TP Hồ Chí Minh).

Tại phiên phúc thẩm, TAND Tối cao tại Đà Nẵng đã tuyên các bị cáo trên vẫn phạm tội tham ô như phiên sơ thẩm đã tuyên vào ngày 17/8/2012. Tuy nhiên, trong quá trình từ khi bị khởi tố điều tra đến nay, các bị cáo đã ăn năn hối cải, khắc phục hậu quả.

Chương trình SEMLA Phú Yên là Chương trình Hợp tác Việt Nam - Thụy Điển được thực hiện từ tháng 1/2007 đến tháng 11/2009 với tổng kinh phí 13,5 tỷ đồng do Chính phủ Thụy Điển viện trợ không hoàn lại cùng vốn đối ứng của tỉnh Phú Yên. Trong quá trình thực hiện các nội dung thuộc chương trình này như: Xây dựng hệ thống quan trắc môi trường tỉnh Phú Yên; xây dựng hương ước bảo vệ môi trường tại xã An Chấn (huyện Tuy An) và xã Xuân Thọ 2 (thị xã Sông Cầu); điều tra khảo sát vùng ngập mặn tại huyện Tuy An và thị xã Sông Cầu…

Ba bị cáo trên cùng 7 bị cáo khác là cán bộ Sở TN&MT Phú Yên đã nhiều lần lập khống chứng từ đưa vào thanh toán, chiếm đoạt hơn 430 triệu đồng. Trong quá trình điều tra vụ án, các bị cáo cùng những người thuộc Sở TN&MT Phú Yên có liên quan đã nộp hơn 449 triệu đồng để khắc phục hậu quả.