Toàn ngành đã thanh tra, kiểm tra được 39.157 doanh nghiệp; kiểm tra được 494.930 hồ sơ khai thuế tại cơ quan Thuế. Tổng số thuế tăng thu qua thanh tra, kiểm tra là 7.123,75 tỷ đồng, bằng 128,58% cùng kỳ năm 2015, đã đôn đốc thực hiện nộp ngân sách 2.949,87 tỷ đồng, đạt 41,41% số thuế tăng thu qua thanh tra, kiểm tra và bằng 78,35% so với cùng kỳ năm 2015.

Đối với công tác thanh tra thuế, toàn ngành Thuế đã ban hành được 3.726 kết luận sau thanh tra; tổng số thuế truy thu, truy hoàn và phạt vi phạm hành chính về thuế qua thanh tra là 3.293,17 tỷ đồng, bằng 130,06% so với cùng kỳ năm 2015, đã đôn đốc thực hiện nộp ngân sách là 1.272,4 tỷ đồng, đạt 38,6% số thuế tăng thu qua thanh tra và bằng 71,47% cùng kỳ năm 2015.

Đối với kiểm tra thuế tại trụ sở người nộp thuế: Toàn ngành Thuế đã ban hành 35.431 kết luận, quyết định xử lý sau kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế; tổng số thuế truy thu, truy hoàn và phạt vi phạm hành chính về thuế qua kiểm tra là 3.622,31 tỷ đồng, bằng 128,95% cùng kỳ năm 2015; đã đôn đốc nộp ngân sách 1.469,19 tỷ đồng, đạt 40,4% số thuế tăng qua kiểm tra và bằng 82,30% cùng kỳ năm 2015.

Kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan Thuế: Kiểm tra được 494.930 hồ sơ bằng 57,80% cùng kỳ năm 2015; xử lý điều chỉnh thu vào ngân sách 208,28 tỷ đồng bằng 104,55% cùng kỳ năm 2015.

Tuy nhiên, hoạt động theo dõi, đôn đốc, kiểm tra việc thực hiện kết luận, kiến nghị, quyết định xử lý sau thanh tra hiện nay đang gặp không ít khó khăn, như: Quy định của pháp luật về thanh tra còn bất cập, thiếu quy định về các biện pháp cưỡng chế trong xử lý sau thanh tra, chế tài xử lý trong việc không chấp hành thực hiện kết luận thanh tra, nhất là chưa có các văn bản hướng dẫn về trình tự thủ tục, xử lý sau thanh tra; pháp luật hiện hành chưa xác định rõ một cơ quan chuyên trách có trách nhiệm thực hiện, thi hành kết luận thanh tra.

Do đặc thù của ngành Thuế là những kết luận sau thanh tra, kiểm tra thuế chủ yếu là việc truy thu số tiền thuế, tiền phạt, tiền chậm nộp tăng qua thanh tra, kiểm tra. Tất cả các kết luận, quyết định xử lý sau thanh tra đều được theo dõi, đôn đốc nộp vào ngân sách Nhà nước theo quy định tại các quy trình thanh tra, kiểm tra thuế và các quy trình quản lý nợ thuế, cưỡng chế nợ thuế, do đó với số lượng doanh nghiệp được thanh tra, kiểm tra rất lớn (khoảng từ 70 đến 80 nghìn doanh nghiệp), thì việc tổng hợp báo cáo kết quả đôn đốc nộp ngân sách Nhà nước chi tiết từng cuộc thanh tra, kiểm tra hàng quý và tổng hợp cả năm để báo cáo là rất lớn.

Do đó, đề nghị Thanh tra Bộ Tài chính sửa lại biểu mẫu báo cáo đính kèm Quyết định số 2316/QĐ-BTC ngày 9/9/2014 chỉ tổng hợp số liệu kết quả đôn đốc thu nộp ngân sách Nhà nước qua thanh tra, kiểm tra tổng hợp theo từng Cục Thuế mà không chi tiết theo từng doanh nghiệp.

Bước đầu thực hiện Thông tư số 01/2013/TT-TTCP ngày 12/3/2013 của Thanh tra Chính phủ; cùng với sự hướng dẫn, đôn đốc của Thanh tra Bộ Tài chính, công tác thu hồi sau thanh tra trong thời gian tới của Tổng cục Thuế sẽ có nhiều hiệu quả, từ đó giúp cho công tác chỉ đạo điều hành của ngành Thuế được chặt chẽ, góp phần thực hiện tích cực công tác quản lý điều hành ngân sách Nhà nước.

Mai Mai