Theo kết luận thanh tra, qua thanh tra việc thành lập và hoạt động của hội đồng trường; tuyển sinh, quản lý đào tạo; điều kiện mở ngành và duy trì ngành các trình độ giáo dục đại học; bồi dưỡng, quản lý cấp phát văn bằng chứng chỉ cho thấy Trường Đại học Giáo dục, Đại học Quốc gia Hà Nội đã quan tâm đến việc triển khai, thực hiện công tác bảo đảm chất lượng giáo dục, kiểm định cơ sở giáo dục cũng như chương trình giáo dục.
Trường đã ban hành quy chế về quản lý văn bằng, chứng chỉ, thực hiện quản lý việc tổ chức in phôi, bảo mật, cấp phát phôi văn bằng, chứng chỉ; quản lý phôi văn bằng, chứng chỉ thu hồi; hủy bỏ văn bằng chứng chỉ theo quy định tại Thông tư số 21/2019/TT-BGDĐT.
Tuy nhiên, bên cạnh kết quả đạt được, Trường Đại học Giáo dục còn có nhiều thiếu sót như chưa kịp thời rà soát, chỉnh sửa, ban hành một số văn bản, quy định nội bộ của trường để tổ chức, quản lý quá trình tuyển sinh, đào tạo theo quy định.
Chậm thành lập Hội đồng Trường. Tại thời điểm thanh tra, trường chưa thực hiện kiện toàn Bí thư Đảng ủy kiêm Chủ tịch Hội đồng Trường theo đúng chủ trương của Đảng.
Theo Thanh tra Bộ GDĐT, Hội đồng Trường ban hành quy chế dân chủ cơ sở và quy chế quản lý tài chính bằng quyết định là không đúng nguyên tắc làm việc của Hội đồng Trường theo quy định tại khoản 10 Điều 1 Luật số 34/2018/QH14; kiện toàn, bổ sung thành viên Hội đồng Trường không đầy đủ hồ sơ không đảm bảo quy định; chưa kịp thời ban hành một số văn bản thuộc trách nhiệm và quyền hạn của mình theo quy định, chưa thực hiện quy trình, thủ tục quyết định nhân sự Hiệu trưởng theo nhiệm kỳ Hội đồng Rrường theo quy định.
Trường chưa thực hiện tuyển sinh theo ngành đối với các ngành thuộc nhóm ngành/lĩnh vực đào tạo giáo viên theo quy định của Bộ GDĐT; đề xuất Bộ xác định chỉ tiêu liên thông vừa làm vừa học năm 2020 có nội dung xác định chỉ tiêu vừa làm vừa học giai đoạn 2021 - 2030 là không phù hợp với nguyên tắc xác định chỉ tiêu tuyển sinh theo năm tại Thông tư sổ 06/2018/TT-BGDĐT; Thông tư số 03/2022/TT-BGDĐT và khoản 1 Điều 5 Quyết định số 18/2017/QĐ-TTg.
Giám đốc Đại học Quốc gia Hà Nội ban hành quyết định công nhận Phó Chủ tịch Hội đồng Trường đối với ông Nguyễn Đức Huy không đúng thẩm quyền.
Ngoài ra, Thanh tra Bộ GDĐT chỉ ra một số vi phạm như năm 2021, trường tuyển sinh ngành Sư phạm Sinh học vượt chỉ tiêu 15% và ngành Tham vấn học đường vượt chỉ tiêu 6,67%, Đại học liên thông vừa làm vừa học ngành Giáo dục Mầm non vượt chỉ tiêu 131,6%, ngành Giáo dục Tiểu học vượt chỉ tiêu 41,75%; năm 2022 ngành Tham vấn học đường vượt chỉ tiêu 16,67% và ngành Quản trị công nghệ giáo dục vượt chỉ tiêu 25%, vi phạm khoản 3 Điều 10 Nghị định số 04/2021/NĐ-CP ngày 22/1/2021 của Chính phủ về xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực giáo dục. Đến thời điểm thanh tra đã hết thời hiệu xử phạt theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 6 Luật Xử lý vi phạm hành chính số 15/2012/QH13 ngày 20/6/2012 được sửa đổi, bổ sung tại Luật số 67/2020/QH14 ngày 13/11/2020.
Chưa kịp thời rà soát, chỉnh sửa, cập nhật các chương trình đào tạo trình độ tiến sĩ của trường theo quy định tại Thông tư sổ 17/2021/TT-BGDĐT; chưa phối hợp với cơ quan công an địa phương nơi cơ sở giáo dục đóng trụ sở chính trong việc in, bảo mật, quản lý, sử dụng phôi chứng chỉ theo điểm c, khoản 2, Điều 12 Thông tư số 21/2019/TT-BGDĐT.
Trách nhiệm dẫn đến những thiếu sót, vi phạm trên theo Thanh tra Bộ GDĐT thuộc Hiệu trưởng, Phó Hiệu trưởng Trường Đại học Giáo dục, Hội đồng Trường, Chủ tịch Hội đồng Trường và bộ phận tham mưu của trường, Đại học Quốc gia Hà Nội và các bộ phận tham mưu.
Trên cơ sở kết quả thanh tra, Thanh tra Bộ GDĐT kiến nghị Trường Đại học Giáo dục thực hiện trách nhiệm và quyền hạn của Hội đồng trường theo đúng quy định của Đảng, pháp luật của Nhà nước về tự chủ của cơ sở giáo dục Đại học; thực hiện lưu trữ đầy đủ hồ sơ liên quan đến việc kiện toàn, bổ sung thành viên Hội đồng trường theo quy định tại Luật Giáo dục Đại học, được sửa đổi, bổ sung tại Luật số 34/2018/QH14 và Quy chế tổ chức và hoạt động của trường; rà soát toàn bộ các văn bản, quy định nội bộ của trường, kịp thời sửa đổi, bổ sung, ban hành văn bản mới theo thẩm quyền cho phù hợp với quy định của Đảng, pháp luật Nhà nước và của Bộ GDĐT; thực hiện rà soát, cập nhật, chỉnh sửa và ban hành các chương trình đào tạo trình độ Đại học, trình độ Thạc sĩ, trình độ Tiến sĩ của trường theo quy định; thực hiện tổ chức tuyển sinh, quản lý đào tạo, bồi dưỡng, quản lý cấp phát văn bằng chứng chỉ và các điều kiện bảo đảm chất lượng theo đúng quy định pháp luật hiện hành.
Rà soát, bổ sung đội ngũ giảng viên cơ hữu chủ trì ngành để đáp ứng theo quy định hiện hành tại Thông tư số 17/2021/TT-BGDĐT, có lộ trình bổ sung đội ngũ giảng viên của trường theo đúng quy định tại Thông tư số 01/2024/TT-BGDĐT ngày 5/2/2024 của Bộ GDĐT ban hành chuẩn cơ sở giáo dục đại học.
Đối với Đại học Quốc gia Hà Nội, Thanh tra Bộ GDĐT kiến nghị thực hiện đúng quy định về quyền tự chủ giáo dục Đại học theo quy định; rà soát, chỉnh sửa, ban hành kịp thời các quy định của đại học để thực hiện quản lý và chỉ đạo các trường thành viên thực hiện quản lý đào tạo theo quy định.
Làm rõ, báo cáo Bộ GDĐT việc chậm thành lập Hội đồng trường đối với Trường Đại học Giáo dục và việc quyết định công nhận Phó chủ tịch Hội đồng trường của Trường Đại học Giáo dục không đúng quy định pháp luật; làm rõ việc sử dụng chung nguồn lực theo mô hình a+b, báo cáo Bộ GDĐT đề xuất hướng xử lý để hoàn thiện mô hình Đại học Quốc gia.
Trường Đại học Giáo dục và Đại học Quốc gia Hà Nội tổ chức kiểm điểm, làm rõ trách nhiệm (nếu có) của tổ chức, cá nhân thuộc quyền quản lý của trường để xảy ra những thiếu sót, vi phạm được chỉ ra qua thanh tra; báo cáo kết quả thực hiện kết luận thanh tra theo quy định.