Cáo trạng của Viện KSND tối cao nêu rõ vào ngày 15-3-2008, Vinalines ký hợp đồng mua ụ nổi 83M, thuê vận chuyển từ cảng Nakhodka (Liên bang Nga) về Việt Nam, làm thủ tục nhập khẩu thông quan tại Hải quan cảng Vân Phong, tỉnh Khánh Hòa. Do tình trạng ụ nổi 83M đã cũ, hư hỏng nhiều nên Vinalines ký hợp đồng thuê Nhà máy sửa chữa tàu biển Hyundai Vinashin sửa chữa, tính đến tháng 3-2010 hết 197 tỉ đồng. Sau khi ký hợp đồng sửa chữa, Vinalines giao nhiệm vụ cho Công ty TNHH sửa chữa tàu biển Vinalines quản lý, giám sát sửa chữa ụ nổi 83M.

Lợi dụng chức vụ quyền hạn được giao, bị can Trần Hải Sơn đã thông đồng với Trần Văn Quang, Trần Bá Hùng, Phạm Bá Giáp ký hợp đồng sửa chữa một số công việc phần sắt hàn và kẽm chống ăn mòn, giá trị hợp đồng hơn 7,2 tỉ đồng và hợp đồng sửa chữa một số công việc phần van, ống, máy và phần chống ăn mòn vỏ ụ nổi 83M với giá trị gần 1,5 tỉ đồng.

Số tiền chiếm đoạt được từ hai hợp đồng, Trần Hải Sơn chiếm đoạt 2,2 tỉ đồng, Trần Văn Quang chiếm đoạt 857 triệu đồng, Trần Bá Hùng chiếm đoạt 395 triệu đồng, Phạm Bá Giáp được hưởng 178 triệu đồng nhờ việc cho mượn tư cách pháp nhân Công ty TNHH Nguyên Ân, ký hợp đồng, ký thanh quyết toán và thanh lý hợp đồng để giúp các bị can chiếm đoạt tiền.

Đáng chú ý, trong số tiền 2,2 tỉ đồng chiếm đoạt được, Trần Hải Sơn khai nhận đã chi mua quà biếu Dương Chí Dũng (nguyên chủ tịch HĐTV Tổng công ty Hàng hải VN - Vinalines) vào các dịp lễ, tết năm 2008, 2009, 2010 gồm quà và tiền hết 300 triệu đồng. Bản thân Dương Chí Dũng cũng thừa nhận có việc được biếu tiền và quà nhiều lần nhưng tổng trị giá chỉ khoảng 150 triệu đồng.