Trong thời kỳ thanh tra, Sở NN&PTNT đã tham mưu, giúp UBND tỉnh thực hiện công tác quản lý Nhà nước theo quy định của các luật chuyên ngành; ban hành các văn bản quản lý các lĩnh vực: Trồng trọt, bảo vệ thực vật; quản lý chất lượng nông - lâm sản và thuỷ sản; chăn nuôi, thú y và thuỷ sản, phục vụ công tác quản lý Nhà nước chuyên ngành tại địa phương; xây dựng nội dung chiến lược phát triển chăn nuôi của địa phương phù hợp với chiến lược phát triển chăn nuôi trên phạm vi cả nước và chiến lược phát triển kinh tế - xã hội của địa phương, trình UBND tỉnh về kế hoạch phát triển chăn nuôi giai đoạn 2021- 2025, định hướng đến năm 2045 trên địa bàn tỉnh.

Ngoài những mặt đạt được, đoàn thanh tra đã chỉ ra những mặt còn tồn tại, hạn chế như: Sở NN&PTNT chưa báo cáo Bộ NN&PTNT (báo cáo hàng năm qua Cục Bảo vệ thực vật) việc thực hiện nhiệm vụ quản lý Nhà nước về phân bón theo quy định tại khoản 5, Điều 26 Nghị định số 84/2019/NĐ-CP của Chính phủ quy định về quản lý phân bón; chưa tham mưu, trình UBND tỉnh ban hành chính sách hỗ trợ sản xuất, buôn bán và sử dụng phân bón trên địa bàn tỉnh Long An năm 2020 theo quy định tại khoản 1, Điều 26 Nghị định số 84/2019/NĐ-CP ngày 14/11/2019 của Chính phủ quy định về quản lý phân bón.

Qua kiểm tra, xác minh tại 3 đơn vị trực thuộc sở gồm: Thanh tra Sở; Chi cục Trồng trọt, Bảo vệ thực vật và Quản lý chất lượng nông sản; Chi cục Chăn nuôi, Thú y và Thuỷ sản, đoàn thanh tra nhận định:

Về hoạt động cấp phép tại Chi cục Trồng trọt, Bảo vệ thực vật và Quản lý chất lượng nông sản, một số tài liệu trong hồ sơ cấp giấy xác nhận nội dung quảng cáo thuốc bảo vệ thực vật và giấy xác nhận nội dung quảng cáo phân bón không thực hiện theo mẫu quy định; hồ sơ tiếp nhận đăng ký công bố hợp quy phân bón, thuốc bảo vệ thực vật thiếu một số tài liệu; thuốc bảo vệ thực vật trên giấy phép vận chuyển không trùng khớp tên thuốc trong đơn đề nghị cấp giấy phép vận chuyển thuốc bảo vệ thực vật; thành phần hồ sơ cấp, cấp lại giấy chứng nhận cơ sở đủ điều kiện an toàn thực phẩm không đầy đủ thông tin, không phải là bản chính theo quy định...

Tại Chi cục Chăn nuôi, Thú y và Thuỷ sản, cũng xảy ra tình trạng hồ sơ cấp phép bị thiếu tài liệu nhưng vẫn được cấp, cụ thể là: Hồ sơ cấp, cấp lại giấy chứng nhận cơ sở đủ điều kiện sản xuất, ương dưỡng giống thủy sản và hồ sơ cấp, cấp lại giấy chứng nhận đủ điều kiện sản xuất thức ăn thủy sản, sản phẩm xử lý môi trường nuôi trồng thủy sản thiếu một số tài liệu minh chứng cho các nội dung trong bản thuyết minh điều kiện cơ sở sản xuất; biên bản kiểm tra duy trì không ghi đúng, đủ nội dung; có tổ chức, cá nhân quá thời hạn kiểm tra duy trì nhưng chưa được kiểm tra và chưa được công bố thông tin trên hệ thống cơ sở dữ liệu quốc gia về thủy sản theo quy định; hồ sơ cấp, cấp lại, thu hồi giấy phép khai thác thủy sản trên biển có một số trường hợp không đầy đủ giấy tờ theo quy định, các nội dung trên giấy phép khai thác không được điền đầy đủ thông tin; chưa thực hiện thẩm tra biên bản thẩm định và thông báo công khai trên phương tiện thông tin đại chúng những tàu cá được cấp giấy chứng nhận cơ sở đủ điều kiện an toàn thực phẩm; có giấy chứng nhận không đủ thời gian theo quy định của Luật An toàn thực phẩm...

Trong công tác thanh tra, kiểm tra, xử lý vi phạm hành chính, khi nhận được tin báo của Thanh tra Bộ và các địa phương khác chuyển đến đề nghị truy xuất nguồn gốc và xử lý đối với hàng hoá là vật tư nông nghiệp giả, kém chất lượng, Thanh tra Sở và các chi cục đã thực hiện thanh tra đột xuất và có một số văn bản phúc đáp về kết quả thanh tra, xử lý vi phạm.

Tuy nhiên, tại Thanh tra Sở, qua kiểm tra ngẫu nhiên 6/68 hồ sơ xử phạt vi phạm hành chính, đoàn thanh tra cho rằng việc lập biên bản vi phạm hành chính không kịp thời dẫn đến quyết định xử phạt chậm, có trường hợp xác định không đúng hành vi vi phạm; một số mẫu gửi đi phân tích chất lượng quá lâu, khi có kết quả (không đạt chất lượng) thì hàng hóa vi phạm đã bị tiêu thụ hết, không áp dụng được biện pháp xử phạt bổ sung; việc thực hiện thông báo tạm dừng lưu thông hàng hóa vi phạm sau khi có kết quả còn chậm; một số quyết định xử phạt vi phạm hành chính không ghi thời hạn thực hiện, biện pháp khắc phục hậu quả; chưa thực hiện việc giám sát thu hồi tang vật vi phạm hành chính...

Tại Chi cục Trồng trọt, Bảo vệ thực vật và Quản lý chất lượng nông sản, việc lập biên bản vi phạm hành chính và ban hành quyết định xử phạt vi phạm hành chính không kịp thời theo quy định (sau khi ban hành kết luận thanh tra), quyết định xử phạt vi phạm hành chính không ghi thời hạn thực hiện, biện pháp khắc phục hậu quả, không có hồ sơ thực hiện biện pháp khắc phục hậu quả.

Chi cục Chăn nuôi, Thú y và Thuỷ sản không có văn bản báo cáo Sở NN&PTNT tỉnh Long An hoặc văn bản phúc đáp đối với Sở NN&PTNT tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu về kết quả thanh tra, xử lý vi phạm; các quyết định xử phạt vi phạm hành chính có áp dụng biện pháp khắc phục hậu quả nhưng không ghi thời hạn thực hiện biện pháp khắc phục hậu quả; không có hồ sơ thể hiện việc đã thực hiện các biện pháp khắc phục hậu quả; quá trình thanh tra phát hiện một số hành vi vi phạm ở khâu buôn bán, nhưng trong một số trường hợp đoàn thanh tra không đề nghị truy xuất nguồn gốc để xử lý triệt để vi phạm; tang vật vi phạm có số lượng ít, đoàn thanh tra niêm phong giao cho chủ cơ sở tự tiêu huỷ, nhưng không lập biên bản tiêu huỷ và cũng không giám sát quá trình tiêu huỷ tang vật.

Đoàn thanh tra kiến nghị Sở NN&PTNT tỉnh Long An cần nghiêm túc chấn chỉnh, rút kinh nghiệm trong công tác quản lý Nhà nước lĩnh vực chuyên ngành chăn nuôi, thú y, trồng trọt, bảo vệ thực vật, thuỷ sản, quản lý chất lượng nông - lâm sản và thuỷ sản; chỉ đạo các cơ quan chuyên môn rà soát công tác tham mưu, hoạt động cấp phép, quản lý sau cấp phép và công tác thanh tra chuyên ngành tại địa phương; kịp thời khắc phục những tồn tại, thiếu sót đã nêu tại kết luận thanh tra để thực hiện tốt hơn nhiệm vụ quản lý Nhà nước chuyên ngành trong thời gian tới.