Theo đó, 10 bị cáo: Nguyễn Kim Phúc (nguyên Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường Phú Yên) 4 năm tù; Hà Thượng Trúc (SN 1959, nguyên Kế toán trưởng); Nguyễn Văn Mẫu (SN 1966, nguyên Chánh Văn phòng); Võ Văn Dũng (SN 1978, nguyên Thư ký chuyên trách Chương trình Semla Phú Yên) và Võ Ngọc Tuân (SN 1976, Phó Chi cục môi trường), mỗi bị cáo 3 năm tù; bị cáo Phan Thế Quốc (SN 1973, nguyên chuyên viên Chương trình Semla Phú Yên) 2 năm 6 tháng tù; Nguyễn Thị Thanh Vy (SN 1967, Phó Chi cục Môi trường) và các bị cáo Trần Thị Na (SN 1968, nguyên Phó phòng, Trưởng nhóm Đất đai Chương trình Semla Phú Yên), Lưu Phạm Bá Luân (SN 1981, nguyên chuyên viên Chương trình Semla Phú Yên) và Phan Thị Kim Oanh (SN 1979, Phó phòng Môi trường) mỗi bị cáo 2 năm 6 tháng tù, nhưng cho hưởng án treo cùng về tội "tham ô tài sản".

Theo cáo trạng của Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Phú Yên: Từ tháng 1/2007 đến 11/2009, trong quá trình triển khai thực hiện Chương trình Semla Phú Yên để xây dựng hương ước bảo vệ môi trường tại xã An Chấn (huyện Tuy An) và xã Xuân Thọ 2 (thị xã Sông Cầu), xây dựng hệ thống quan trắc môi trường tỉnh Phú Yên, điều tra khảo sát vùng ngập mặn tại huyện Tuy An và thị xã Sông Cầu, Nguyễn Kim Phúc và 9 bị cáo vừa nêu trên đã lợi dụng chức năng, nhiệm vụ được giao trong quá trình đi công tác, thực hiện dự án và nhiều lần lập khống chứng từ đưa vào thanh toán rút 430 triệu đồng của dự án để chiếm đoạt sử dụng cá nhân.

Trước đó, ngày 17/8/2012, Tòa án nhân dân tỉnh Phú Yên xử sơ thẩm, tuyên phạt nguyên Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường Phú Yên Nguyễn Kim Phúc 3 năm tù về tội "tham ô tài sản". Cùng tội danh trên, tòa còn tuyên phạt tù 2 bị cáo Hà Thượng Trúc và Nguyễn Văn Mẫu mỗi bị cáo 2 năm 6 tháng tù giam. Còn lại, các bị cáo khác bị tuyên từ 2 năm đến 2 năm 6 tháng tù nhưng cho hưởng án treo.

Sau đó các bị cáo Phúc, Trúc và Mẫu đã làm đơn kháng án và ngày 22/11/2012, Tòa Phúc thẩm Tòa án nhân dân Tối cao tại Đà Nẵng xử phúc thẩm, sửa bản án sơ thẩm, tuyên phạt các bị cáo Phúc, Mẫu, Trúc từ tù giam xuống thành tù treo.

Tuy nhiên, đến ngày 6/1/2014, Chánh án Tòa án nhân dân Tối cao kháng nghị và được Hội đồng Thẩm phán chấp nhận tuyên hủy hai bản án vừa nêu. Lý do Hội đồng Thẩm phán hủy ản là do Hội đồng Xét xử cấp sơ thẩm và phúc thẩm không áp dụng đúng quy định của pháp luật về chế định án treo, bản án không đáp ứng yêu cầu giáo dục, phòng chống tội phạm tham ô tài sản.

Thế Lập