Kết luận chỉ ra, việc quy định cho Giám đốc Sở TN&MT được phép sử dụng con dấu của Sở TN&MT cấp giấy phép tài nguyên nước là chưa phù hợp theo quy định của pháp luật. 

Khi thực hiện các dự án trong lĩnh vực tài nguyên nước chưa điều tra, đánh giá hiện trạng khai thác sử dụng tài nguyên mặt nước phục vụ công tác quản lý Nhà nước về tài nguyên nước. 

Hệ thống thông tin dữ liệu về tài nguyên nước trên địa bàn tỉnh chưa được xây dựng, cập nhật; chưa triển khai cho phép Trung tâm Khai thác, quản lý công trình thủy lợi tỉnh đang quản lý, khai thác mặt nước tại các hồ thủy lợi, hồ đa mục tiêu như: Hồ Đá Đen, hồ Suối Các, hồ Châu Pha, hồ Kim Long; trong khi đó, đơn vị này khai thác nước để bán cho một số đơn vị trên địa bàn tỉnh. 

Việc quy định tần xuất quan trắc trong nội dung giấy phép khai thác, sử dụng nước dưới đất chưa đúng Quyết định 15/2008/QĐ-BTNMT ngày 31/12/2008 quy định về bảo vệ tài nguyên nước dưới đất; chưa thực hiện thường xuyên, định kỳ công tác hậu kiểm cấp phép thăm dò, khai thác sử dụng tài nguyên nước, xả nước thải vào nguồn nước.

Công tác cấp phép trong lĩnh vực tài nguyên nước, đoàn thanh tra chỉ ra, đến tháng 12/2012, tỉnh đã cấp 114 giấy phép, đồng thời tiến hành kiểm tra 5 bộ hồ sơ được cấp giấy phép cho thấy quy trình tiếp nhận, thẩm định hồ sơ đề nghị cấp phép đều đúng theo quy định. Tuy nhiên, một số quy định trong nội dung giấy phép đã cấp chưa đầy đủ, trong nội dung giấy phép khai thác nước dưới đất yêu cầu tổ chức, cá nhân thực hiện chế độ quan trắc mực nước 1 tháng 3 lần là chưa phù hợp với quy định.

Kiểm tra 12 đơn vị khai thác, sử dụng nước, xả nước thải vào nguồn nước cho thấy, 1/4 đơn vị không có giấy phép khai thác, sử dụng nước dưới đất; 2/3 đơn vị không có giấy phép sử dụng mặt nước; 2/11 đơn vị xả nước thải vào nguồn nước không có giấy phép; 3/3 đơn vị đã được cấp giấy phép khai thác, sử dụng nước dưới đất không thực hiện, thực hiện không đầy đủ việc quan trắc mực nước, lưu lượng khai thác, lưu lượng khai thác không đúng theo nội dung giấy phép; 1 đơn vị đã được cấp giấy phép khai thác sử dụng mặt nước không lắp đặt thiết bị giám sát lưu lượng, chất lượng nguồn mặt nước; 5/9 đơn vị đã được cấp giấy phép xả nước thải vào nguồn nước; không thực hiện đầy đủ việc quan trắc lưu lượng, chất lượng nước thải sau xử lý, chất lượng nguồn tiếp nhận nước thải, lưu lượng xả thải không đúng theo nội dung giấy phép; 3/12 đơn vị không báo cáo cơ quan có thẩm quyền việc thay đổi tên chủ giấy phép do sát nhập, cơ cấu lại tổ chức.

Đoàn thanh tra đã lập và bàn giao toàn bộ các biên bản thanh tra, 5 biên bản vi phạm hành chính cho Sở TN&MT tỉnh để xử lý, đôn đốc, kiểm tra, giám sát đối với 12 tổ chức, cá nhân được thanh tra với tổng số tiền trên 50 triệu đồng.

Bộ TN&MT kiến nghị UBND tỉnh chỉ đạo thực hiện điều tra, đánh giá hiện trạng khai thác, sử dụng tài nguyên nước mặt phục vụ công tác quản lý Nhà nước về tài nguyên nước, xây dựng cập nhật, hệ thống hóa thông tin, dữ liệu tài nguyên nước trên địa bàn; triển khai Đề án “Quy hoạch khai thác bền vững và bảo vệ tài nguyên mặt nước trên địa bàn tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu đến năm 2015 và tầm nhìn đến năm 2020”; tăng cường công tác hậu kiểm cấp phép thăm dò, khai thác sử dụng tài nguyên nước, xả nước thải vào nguồn nước; xử lý kiên quyết các vi phạm được phát hiện trong quá trình thanh tra, kiểm tra; quan tâm công tác kiểm tra, giám sát và hướng dẫn các cá nhân, tổ chức thực hiện khắc phục sai phạm sau thanh tra; tăng cường biên chế, nhân sự thực hiện nhiệm vụ quản lý Nhà nước về tài nguyên nước; chỉ đạo xử lý các sai phạm, báo cáo về Bộ TN&MT trước ngày 10/12.

Bảo Anh