Ông Vũ Hải Quân sinh năm 1974 tại Ninh Bình. Ông tốt nghiệp khoa toán - tin Trường ĐH Khoa học tự nhiên (ĐH Quốc gia TP. Hồ Chí Minh) năm 1996.

Từ năm 2001 đến 2005, ông Vũ Hải Quân làm nghiên cứu sinh tại Trường ĐH Tổng hợp Trento, Ý và đạt học vị tiến sĩ. 

Sau đó, ông Quân tiếp tục nghiên cứu sau tiến sĩ tại Trường ĐH Leuven, Bỉ. Tháng 2/2005, ông bảo vệ thành công luận án tiến sĩ và nhận học bổng postdoc ở ĐH Tổng hợp Leuven. 

Trở về nước năm 2007, ông Quân lần lượt giữ nhiều chức vụ như: Giám đốc Trung tâm Đào tạo quốc tế ITEC và trưởng phòng thí nghiệm trí tuệ nhân tạo AILab, Phó Hiệu trưởng Trường ĐH Khoa học tự nhiên (ĐH Quốc gia TP. Hồ Chí Minh).

Ngày 5/10/2017, ông được Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm giữ chức vụ Phó Giám đốc ĐH Quốc gia TP. Hồ Chí Minh.